女巨人继续追击艾伦，艾伦又一次想要巨人化，利威尔班剩余的三人劝阻艾伦，希望艾伦相信他们，让他们去战斗，艾伦选择了相信并继续前进，看到剩余的三人在刚刚失去了根塔先生的情况下仍就那么强大，艾伦开始庆幸自己的选择，正在这时，女巨人突然进攻将剩余三人杀害，目睹利威尔班全军覆没的艾伦开始愤怒，巨人化开始咆哮，攻击女巨人，远处的三笠，兵长听到艾伦的咆哮就往艾伦所在之处奔去，此时已经处于极度愤怒状态的艾伦正在和女巨人交战，可最终不幸败下阵来，正当女巨人要吃下艾伦之时，艾伦终于明白女巨人的真实身份，女巨人将艾伦吞食，远处赶来的三笠正好看见了这一切，女巨人吞食艾伦后开始逃跑，三笠追赶，要将女巨人杀死将艾伦救出来，兵长此时也已赶到，两人一起追赶女巨人。
兵长与三笠为了击杀女巨人分工合作，在兵长扭伤脚后救出了艾伦，此时的艾伦已经被粘液包裹的无法动弹。两人在重伤女巨人后撤退。兵长向后望去，女巨人在树下靠着竟流下了眼泪。女巨人一战落幕，侦查兵团在运送尸体回到壁内的途中又遇见巨人。在无奈之下只好丢弃尸体以拖延巨人。就这样，侦查兵团回到了壁内。
亚妮从沉睡中醒来，和其他宪兵队成员接到上级下达的新任务--护送调查兵团回王都。**的宪兵团上级更是把整个任务全权交给新兵们办理。执行任务前，阿明秘密地找到亚妮，请求其在护送期间协助艾路逃跑。亚妮心存疑虑的答应了。但在逃离斯特黑斯区的最后一步，通过阴暗狭窄的地道时，亚妮却识破阿明原计策。被识破身份的亚妮放弃了艾伦的劝说，露出可怕微笑，利用戒指上的尖钩，在希娜之壁中变身。
逃下地道的三人仁遭到女型巨人堵上一切的袭击。关键时刻，按计划应该变身成巨人的艾伦却因为不愿相信事实而没有成功。三笠和阿明冲出地道想吸引女型巨人的注意，艾伦却先遭袭，被压埋在废墟下，被木头刺穿。女型巨人与调查兵团在城中又是一场恶战，并挣脱了韩吉等人布下的陷阱。另一方面，在阿明的激励下，奄奄一息的的艾伦坚定了驱除巨人的决心，强忍剧痛，成功变身。艾伦与亚妮两人的决斗已经爆发！
城中，两个巨人间爆发激烈的格斗。最终，亚妮最终难敌盛怒狂暴之下的艾伦。极度虚弱的女型巨人想翻越希娜之壁逃脱，被三笠斩断十指摔落，为人类所擒获。然而，艾伦在挖出亚妮本体时的一丝迟疑，使亚妮有机会用坚硬的水晶石保护住自己。调查兵团众人无法打开水晶石，但总算对上级有个交代，保住了调查兵团，使艾伦免去被解剖的麻烦。
在结束了与女巨人的战斗后，调查兵团在墙壁中发现了巨人。面对众人的质疑，司祭自始至终保持沉默，不愿意回答。时间追溯到12小时前，在南区待命的调查兵团104期生收到了巨人来袭的消息，而巨人袭击的方向，正是康尼·斯普林格的故乡。康尼·斯普林格因此向巨人行进的方向进发，而此时，分队长采取了单独的行动。
巨人被发现的5个小时之后，往北方森林前进的人们到达了萨莎的故乡。萨莎想起了与父亲之间的苦涩回忆。时隔3年，家乡已经不再是人类居住的土地，而是遍布了凄惨的景象。另一方面，艾伦同行的人中不见了尼克的身影，他希望能够用双眼亲自去确认墙壁的秘密。
康尼的家乡没有任何人影，只剩下一头仰面倒下的巨人。失意的康尼，耳朵听到似乎是那巨人发出的微弱声音……同时，黎各率领驻扎兵团的精锐部队在东防卫线与巨人交战，而汉内斯也在率领部队沿着墙壁一路侦察，但仍然没有遇到一个巨人。每个人各自心惊肉跳着，巨人出现的最初的夜晚即将到来。
康尼，莱纳和贝特霍尔德所在的南班与克里斯塔和尤弥尔的西班在夜晚中相遇，两班决定在厄特加尔城堡过夜。但是，当他们注意到的时候，城四周已经被巨人包围着。没有战斗装备的104期训练兵到塔中暂时避难，不过，城堡被突破只是时间的问题。他们只能孤军奋斗防止巨人的入侵。而这时莱纳脑海中浮现出的记忆是……？
艾伦他们还在训练兵团的时候，某次雪山训练结束后，突然发现克里斯塔和尤弥尔的身影不见了。克里斯塔在训练中发现身体不适的达兹，然而却突发下起暴风雪，克里斯塔决意要拖着奄奄一息的达兹走到山脚下。但是在这种情况下，三个人都不能得到帮助，克里斯塔采取的决断是!?
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